・研究紹介
・Publication (2000 – )
・博士論文題目
・修論・卒論題目
研究紹介
当研究グループでは、（１）富士山地下圏を主な対象とした微生物と水●物質循環、（２）海洋における原核生物群集とウイルスの原核生物制御への地球温暖化の影響、（３）森林土壌の物質変換と微生物の窒素代謝、（４）高温極限環境の微生物生態系、を対象として、それら環境微生物の分布、多様性、活性、増殖速度、物質循環への寄与、地球環境への影響と進化史的な考察に関する研究を行っています（→フィールドを参照）。
（１）富士山地下圏を主な対象とした微生物と水・物質循環
（２）海洋における原核生物群集とウイルスの原核生物制御への地球温暖化の影響
（３）森林土壌の物質変換と微生物の窒素代謝
（４）高温極限環境の微生物生態系
Publication (2000 – )
Books
■2015
1. H. Yamamoto, T. Maruyama, L. G.-To´th, _K. Kato_, Y. Furushima, N.Taira, Y. Maeda, K. Shitashima, In situ determination of bacterial growth in mixing zone of hydrothermal vent field on the Hatoma Knoll, Southern Okinawa Trough. Subseafloor Biosphere Linked to Hydrothermal Systems. pp. 437-447 (2015). (Abstract)
Original Paper
■2017
1.
Ayumi Sugiyama, Suguru Masuda, Kazuyo Nagaosa, Maki Tsujimura, and Kenji Kato (2017) Tracking the direct impact of rainfall on groundwater at Mt. Fuji by multiple analyses including microbial DNA. Biogeosciences. Accepted.
2.
Toshihiko Ohnuki, Naofumi Kozai, Fuminori Sakamoto, Satoshi Utsunomiya, Kenji Kato (2017) Sorption behavior of Np(V) on microbe pure culture and consortia. Chemistry Letters,46:771-774 doi: 10.1246/cl.170068.
3.
Yoshio Takahashi, Qiaohui Fan, Hiroki Suga, Kazuya Tanaka, Aya Sakaguchi, Yasuo Takeichi, Kanta Ono, Kazuhiko Mase, Kenji Kato and Vladimir V. Kanivets (2017) Comparison of solid-water partitions of radiocesium in river waters in Fukushima and Chernobyl areas. Scientific Reports 7, Article number: 12407 doi:10.1038/s41598-017-12391-7.
■2016
1.
Ayumi Sugiyama, Suguru Masuda, Kazuyo Nagaosa, Maki Tsujimura, and Kenji Kato (2016) Tracking the direct impact of rainfall on groundwater at Mt. Fuji by multiple analyses including microbial DNA. Biogeosciences Discussion paper. doi:10.5194/bg-2016-78.
■2015
1.
Takuya Segawa, Ayumi Sugiyama, Takeshi Kinoshita, Rumi Sohrin, Takanori Nakano, Kazuyo Nagaosa, Darius Greenidge, Kenji Kato (2015) Microbes in groundwater of a volcanic mountain, Mt. Fuji; 16S rDNA phylogenetic analysis as a possible indicator for the transport routes of groundwater., Geomicrobiology Journal 32: 677-688. doi: 10.1080/01490451.2014.991811.
2.
Kenji Kato, Takuya Okumura, Takuya Segawa, Takahito Unno, Darius Greenidge, Tetsu Nishioka, Koji Mori, Hiroyuki Tosaka, Kazuyo Nagaosa (2015) Unveiled groundwater flushing from the deep seafloor in Suruga Bay., Limnology 16:79-83. doi: 10.1007/s10201-014-0445-0. (Abstract)
3.
Dao Thi Anh Tuyet, Toshinari Tanaka, Rumi Sohrin, Do Manh Hao, Kazuyo Nagaosa, Kenji Kato (2015) Effects of warming on microbial communities in coastal waters of temperate and subtropical zones in Northern Hemisphere with a focus on Gammaproteobacteria., J.Oceanography 71:91-103. doi: 10.1007/s10872-014-0264-2.
4.
Yoshio Takahashi, Yasutaka Hayasaka, Koichi Morita, Teruhiko Kashiwabara, Ryoichi Nakada, Matthew A. Marcus, Kenji Kato, Kazuya Tanaka, Hiroshi Shimizu (2015) Transfer of rare earth elements (REE) from manganese oxides to phosphates during early diagenesis in pelagic sediments inferred from REE patterns, X-ray absorption spectroscopy, and chemical leaching method. Geochemical Journal, 49:653-674, .
■2014
Hiroki Suga, Qiaohui Fan, Yasuo Takeichi, Kazuya Tanaka, Hiroaki Kondo, Vladimir V. Kanivets, Aya Sakaguch, Kenj Kato, Nobuhto Inam, Kazuhko Mase, Kanta Ono and Yosho Takahashi (2014) Characterization of Particulate Matters in the Pripyat River in Chernobyl Related to Their Adsorption of Radiocesium with Inhibition Effect by Natural Organic Matter., Chemistry Letters 43:1128－1130. doi:10.1246/cl.140222. (Abstract)
■2013
Katsuyama, Chie, Nashimoto Hiroaki, Nagaosa, Kazuyo, Ishibashi Tomotaka, Kinoshita Takeshi, Yoshikawa Hideki, Aoki Kazuhiro, Asano Takahiro, Sasaki Yoshito, Sohrin Rumi, Komatsu Daisuke, Tsunogai Urumu, Kimura Hiroyuki, Suwa Yuichi, Kato Kenji(2013) Occurrence and potential activity of denitrifiers and methanogens in groundwater at 140 m depth in Pliocene diatomaceous mudstone of northern Japan., FEMS Microbiology Ecology 86:532-543. doi: 101111/1574-6941.12179.
■2011
1.
Teruki Amano, Ikuo Yoshinaga, Takao Yamagishi, Chu Van Thuoc, Pham The Thu, Shigeno Ueda, Kenji Kato, Yoshihiko Sako and Yuichi Suwa (2011) Contribution of anammox bacteria to benthic nitrogen cycling in a mangrove forest and shrimp ponds, Haiphong, Vietnam., Microbes and Environments 26:1-6.
2.
Ryouichi Higashi, Akira Tsukagoshi, Hiroyuki Kimura and Kenji Kato(2011) Male dimorphism in a new interstitial species of the genus Microloxoconcha(PODOCOPIDA:OSTRACODA)., Journal of Crustacean Biology 31:142-152.
■2010
1.
Do Manh Hao, Tomokazu Tashiro, Miharu Kato, Rumi Sohrin, Chie Katsuyama, Kazuyo Nagaosa, Hiroyuki Kimura, and Kenji Kato (2010) Population dynamics of Crenarchaeota and Euryarchaeota in the mixing front of river and marine waters. Microbes and Environments 25:126-132. (Abstract)
2.
Hiroyuki Kimura, Kousuke Mori, Hiroaki Nashimoto, Satoshi Hanada, Kenji Kato (2010) In situ biomass production of hot spring sulfur-turf microbial mat. Microbes and Environments 25:140-143. (Abstract)
3.
Hiroyuki Kimura, Hiroaki Nashimoto, Mikio Shimizu, Shohei Hattori, Keita Yamada, Keisuke Koba, Naohiro Yoshida, Kenji Kato (2010) Microbial methane production in deep aquifer associated with the accretionary prism in Southwest Japan. The ISME Journal 4:531-541. (Abstract)
4.
Hiroyuki Kimura, Kousuke Mori, Hiroaki Nashimoto, Shohei Hattori, Keita Yamada, Keisuke Koba, Naohiro Yoshida, Kenji Kato (2010) Biomass production and energy source of thermophiles in a Japanese alkaline geothermal pool. Environmental Microbiology 12:480-489. (Abstract)
5.
Hiroyuki Kimura, Kousuke Mori, Tomokazu Tashiro, Kenji Kato, Toshiro Yamanaka, Jun-Ichiro Ishibashi, Satoshi Hanada (2010) Culture-independent estimation of optimal and maximum growth temperatures of archaea in subsurface habitats based on the G+C content in 16S rRNA gene sequences. Geomicrobiology Journal 27:114-122. (Abstract)
■2009
1.
Chie Katsuyama, Shinji Nakaoka, Yasuhiro Takeuchi, Kanako Tago, Masahito Hayatsu, Kenji Kato (2009) Complementary cooperation between two syntrophic bacteria in pesticide degradation. Journal of Theoretical Biology 256: 644-654.
2.
Kenji Kato, Kazuyo Nagaosa, Hiroyuki Kimura, Chie Katsuyama, Katsunori Hama, Takanori Kunimaru, Urumu Tsunogai, Kazuhiro Aoki (2009) Unique distribution of deep groundwater bacteria constrained by geological setting. Environmental Microbiology Reports 1:569-574.
■2008
1.
Kazuyo Nagaosa, Tomoko Maruyama, Nihal Welikara, Yohei Yamashita, Yui Saito, Daniel Fortin, Kenji Nanba, Iku Miyasaka, Sakae Fukunaga and Kenji Kato (2008) Active bacterial populations and grazing impact revealed by an in situ experiment in a shallow aquifer. Geomicrobiology Journal 25: 131-141.
2.
Chie Katsuyama, Naho Kondo, Yuichi Suwa, Takao Yamagishi, Masayuki Ito, Nobuhito Ohte, Hiroyuki Kimura, Kazuyo Nagaosa, Kenji Kato (2008) Denitrification activity and relevant bacteria revealed by nitrite reductase gene fragments in soil of temperate mixed forest. Microbes and Environments 23: 337-345.
■2007
1.
Takayuki Takenaka, Tomokazu Tashiro, Ayumi Ozaki, Hitomi Takakubo, Yutaka Yamamoto, Tomoko Maruyama, Kazuyo Nagaosa, Hiroyuki Kimura, Kenji Kato (2007) Planktonic bacterial population dynamics with environmental changes in coastal areas of Suruga Bay. Microbes and Environments 22: 257-267.
2.
Hiroyuki Kimura, Jun-Ichiro Ishibashi, Harue Masuda, Kenji Kato, Satoshi Hanada. Selective phylogenetic analysis targeting 16S rRNA genes of hyperthermophilic archaea in the deep-subsurface hot biosphere. Applied and Environmental Microbiology 73: 2110-2117.
■2006
1.
Tomoko Maruyama, Ho-Dong Park, Kazuhiko Ozawa, Yoshinori Tanaka, Tatsuo Sumino, Koei Hamana, Akira Hiraishi, and Kenji Kato (2006) Sphingosinicella microcystinivorans gen. nov., sp. nov., a microcystin-degrading bacterium. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56:85-89.
2.
Hiroyuki Kimura, Maki Sugihara, Kenji Kato, Satoshi Hanada (2006) Selective Phylogenetic Analysis Targeted at 16S rRNA genes of Thermophiles and Hyperthermophiles in Deep-Subsurface Geothermal Environments. Applied and Environmental Microbiology 72:21-27.
■2005
1.
Toshio Takahashi, X. Chatellier, Keiko Hattori, Kenji Kato and Danielle Fortin (2005) Adosorption of rare earth elements onto bacterial cell walls and its implication for REE sorption onto natural microbial mats. Chemical. Geology. 219:53-67.
2.
Hiroyuki Kimura, Maki Sugihara, Hiroyuki Yamamoto, Bharat K.C. Patel, Kenji Kato, Satoshi Hanada (2005) Microbial community in a geothermal aquifer associated with the subsurface of the Great Artesian Basin, Australia. Extremophiles 9:407-414.
■2004
1.
Kenji Kato, Takeshi Kobayashi, Hiroyuki Yamamoto, Takkou Nakagawa, Younosuke Maki and Toshihiro Hoaki (2004) Microbial Mat Boundaries between Chemolithotrophs and Phototrophs in Geothermal Hot Spring Effluent. Geomicrobiology J. 21:91-98
2.
Tomoko Maruyama, Kenji Kato, Park Hordon (2004) Population dynamics of free-living bacteria related to microcystin degradading strain Y2 in Lake Suwa and microcystin amended enrichment. Microbes and Environments19:137-146
■2003
1.
Akira Hiraishi, Mitsuru Iwasaki, Tomoki Kawagishi, Naoko Yoshida, Takashi Narihiro and Kenji Kato (2003) Significance of lipoquinones as quantitative biomarkers of bacterial populations in the environment. Microbes and Environments 18:89-93.
2.
Tomoko Maruyama, Kenji Kato, Atsushi Yokoyama, Toshiki Tanaka, Akira Hiraishi, Ho-Dong Park (2003) Dynamics of microcystin-degrading bacteria in mucilage of Microcystis. Microbial Ecology 46:279-288.
■2002
1.
Hiroshi X. Chiura, Hiroyuki Yamamoto, Daisuke Koketsu, Hiroki Naito and Kenji Kato (2002) Virus-Like Particle derived from a Bacterium belonging to the Oldest Lineage of the Domain Bacteria. Microbes and Environments17:48-52.
2.
Hiroyuki Yamamoto, Katsunori Fujikura, Akira Hiraishi, Kenji Kato and Yunosuke Maki (2002) Phylogenetic chracterization and biomass estimation of bacterial endosymbionts associated with invertebrates dwelling in chemosynthetic communities of hydrothermal vent and cold seep fields. Marine Ecology Progress Series 245:61-67.
■2001
Park, H., Sasaki,Y., Maruyama, T., Hiraishi, A. and Kato, K. (2001) Degradation of the cyanobacterial hepatoxin Micorcystin by a new bacterium isolated from a hypertrophic lake. Environmental Toxicology. 338-343.
■ 博士論文題目
2014年度
・Warming effects on dynamics of microbial communities in coastal waters of temperate and subtropical zones through dilution and frctionation experiments. （海水温上昇が沿岸微生物群集に与える影響～特にガンマプロテオバクテリアに注目して)
Dao Thi Anh Tuyet＊
2011年度
・Population dynamics, diversity of Archaea along temperature and subtropical salinity gradients and their potential function
Do Manh Hao＊
2008年度
・Functioning and diversity of microbial community in soilenvironment
Chie Katsuyama＊
・超好熱性古細菌における金属酵素の発現系の構築とその構造と機能からの進化的解析
鴻巣麻子
2005年
・Nitrate-reducing bacterial community in hypernutrified aquatic environments : 過栄養な水環境に生息する硝酸塩還元細菌の研究
竹内準一
・放射性廃棄物地層処分における微生物影響
福永栄
2002年度
・Microbial ecological study on the degradation process of cyanobacterial hepatotoxin (Microcystin) in natural eutrophic lake
Tomoko Maruyama＊
＊は博士課程。
■ 修論・卒論題目
2016 年度
・Possible viral lytic control of prokaryote in groundwater with low dissolved oxygen concentration.（双木 笙太 修論）
・Detection of denitrifier in groundwater at a single cell level with geneFISH.（桝田 卓修論）
・巨大な湧水河川・柿田川に生息する水生植物に付着する細菌群集が河川水中の細菌群集に与える影響.（門馬 弘幸 卒論）
2015 年度
・富士山西麓において強い雨が湧水に与える直接的影響を微生物学的分析から定量化する試み．(小原 一真 卒論)
・沿岸海洋における原生動物の個体数と群集構成にウイルスが与える影響を探る．(〆木 貴之 卒論)
・富士山地下水における脱窒活性を持つ原核生物群の推定と機能遺伝子nirSによる検出手法の検討．(渡邉 諒也 卒論)
2014 年度
・Multiple analyses to chase the signature of direct impact of rainfall into groundwater in Mt. Fuji. (杉山 歩 修論)
・Impact of warming on viral control of prokaryotic community abundance and structure in temperate coastal water. (田中 勇成 修論)
・地下水中でのウイルスの溶菌による原核生物個体群制御の可能性．(双木 笙太 卒論)
・GeneFISH法を用いてnirS型脱窒菌の機能遺伝子をシングルセルレベルで検出する試み-富士山地下水中での脱窒過程の解明に向けて．(桝田 卓 卒論)
・富士山麓湧水における異なった温度条件下での好熱性細菌の生残性．(勝又 弘貴 卒論)
・降雨強度の違いが土壌層を通過後の地下水へどのように影響するか．(野津田 健 卒論)
2013年度
・深部地下圏におけるバクテリオファージの存在と原核生物個体群制御の可能性．(成瀬 美樹 修論)
・A comparative study on prokaryotic community constitutents in springwater of volcanic mountains, Mt. Aso and Mt. Fuji．(古田 つゆみ 修論)
・富士山地下圏における脱窒活性と脱窒を担うバクテリアのCARD-FISHと定量PCRによる解析．(青島 裕次郎 卒論)
・河口域における間隙水中の原核生物群集への海水の影響．(高田 将明 卒論)
・富士山麓で採取した雨水中のBachillusの構成．(高宮 良樹 卒論)
・塩水と淡水のインターフェイスにおける間隙水中の原核生物群集への海水の影響．(中村 知樹 卒論)
2012年度
・Denitrification activity and its controlling factors in groundwater polluted with nitrate in Mt. Fuji．(木下 岳士 修論)
・富士山麓の湧水への雨水の影響に関する生物地球化学的アプローチ．(杉山 歩 卒論)
・塩水の浸入効果が微生物群集構成に与える要因を菊川で探る．(田中 邦拓 卒論)
・沿岸における海水温上昇がウイルスによる原核生物制御へ与える影響．(田中 勇成 卒論)
2011年度
・Chemical properties of springs and distribution and diversity of its prokaryotes at the foot of Mt. Fuji．(瀬川 琢也 修論)
・nirK GeneFISH ‐detecting denitrifier gene at a single-cell level．(紫藤 真由 卒論）
・地下圏でのウイルスによる原核生物個体群制御の可能性．(成瀬 美樹 卒論）
・駿河湾沿岸におけるBacteriaおよびArchaeaへのTop-down効果とBottom-up効果．(西口 なみ希 卒論）
・花崗岩風化過程における雨水-岩石-微生物相互作用．(光谷 大樹 卒論）
・溶岩の地下水と原核生物への影響‐バッチ培養による解析．(本多 香世子 卒論）
2010年度
・地下深部堆積層におけるメタン生成深度．(梨本 裕晃 修論)
・富士山地下水における硝酸汚染と微生物による脱窒(硝酸還元)について．(木下 岳士 卒論）
2009年度
・富士山地下水は駿河湾沿岸の微生物生態系に影響するか.（奥村 卓也 卒論）
・富士山湧水が作る湧水池および湧水涵養河川の化学的および微生物学的特性.（海野 貴仁 卒論）
・清水港における水温上昇が沿岸域の原核生物の増殖と群集構成に与える影響.（岡部 雅嵩 卒論）
・富士山西南麓湧水群における水環境と原核生物の特徴.（瀬川 琢也 卒論）
・深部地下圏におけるウィルスの検出とその生態に関する研究手法の検討.（古田 一期 卒論）
2008年度
・温帯森林土壌における微生物群集の多様性の解析とその生態学的な意義の考察.（近藤 菜穂 修論）
・古細菌に注目した駿河湾における原核生物の群集構成の解析.（加藤 美春 卒論）
・富士山地下圏における地下水と岩石の相互作用と細菌の分布.（小板 正道 卒論）
2007年度
・Molecular analysis on the vertical profiles and constituents of Archaeain coastal and offshore marine water.（田代 智一 修論）
・好熱性シアノバクテリアマットコンソーシアの遺伝子解析.（藤井 智子 修論）
2006年度
・海洋沿岸ならびに汽水域におけるVibrio cholerae の検出・定量と水温との関係.（竹中 貴之 修論）
・富士山東麓湧水群における地下水環境と細菌の分布.（吾郷 友基 卒論）
・森林土壌の形成における微生物の役割の解明へ向けた微生物群集構造の解析.（近藤 菜穂 卒論）
・駿河湾清水港における微生物群集の構造とその海水温上昇に対する反応.（和田 英里 卒論）
2005年度
・沿岸海洋における浮遊性古細菌の生態.（田代 智一 卒論）
・柿田川および富士山東麓湧水の水環境と細菌の分布.（長岡 篤子 卒論）
・好熱性シアノバクテリアのコンソーシア解析.（藤井 智子 卒論）
2004年度
・帯水層における細菌と原生動物の生態.（齋藤 結 卒論）
・好熱性硫黄酸化細菌の極限温度耐性から生命の軌跡と可能性を探る.（佐藤 梨香 卒論）
・FISH法を用いた駿河湾清水港港内，港外における細菌の群集と環境要因の関係.（高久保 瞳 卒論）
2003年度
・中部山岳の地熱地帯における Cyanobacteriaの分布と温度環境.（小川 朋子 卒論）
・帯水層における地下圏微生物の分布と増殖.（山下 洋平 卒論）
・海洋細菌群集の増殖に対する水温上昇の影響.（山本 完 卒論）
2002年度
・Fluorescence in situ hybridization (FISH)法による駿河湾（清水港）と沖縄（辺野古湾）における沿岸海洋環境中の細菌群集構成の解析.（尾崎 歩 卒論）
・堆積物における細菌の群集構成の解析 堆積物中の細菌細胞の直接計数に対する新技法の提案とその応用.（田利 新 卒論）
・中部山岳地熱地帯の長野県中房温泉におけるfilamentous anoxygenic phototrophic bacteriaの生態.（山根 友希 卒論）