月別: 2020年10月

Sci. Rep.誌に論文掲載 & プレスリリース

Sci. Rep.誌に以下の論文が掲載されました.

Genomic predictions and genome-wide association studies based on RAD-seq of quality-related metabolites for the genomics-assisted breeding of tea plants.
Yamashita H, Uchida T, Tanaka Y, Katai H, Nagano AJ, Morita A, Ikka T*.
Scientific Reports. 10, 17480. https://doi.org/10.1038/s41598-020-74623-7 (2020)

チャ遺伝資源集団の一番茶新芽を対象に、機能性成分含量に関するフェノタイピングおよびSNPs情報 (Yamashita et al., 2019. PLOS ONE) により、
チャのゲノム育種に向けたゲノミックプレディクション (GP) およびゲノムワイド関連解析 (GWAS) の有効性を検証しました.
GPにより、カテキン類やカフェインの予測が可能なこと、またGWASとGPの統合解析により各表現型差異に寄与する候補遺伝子も同定致しました.
D3 山下 筆頭著者、一家准教授 責任著者の論文になります.

当研究成果についてはプレスリリースを発表し、静岡県庁で記者説明を行いました.
「日本茶の機能性成分含量を大量のDNAから予測し、新品種の開発へ 〜品種改良の期間短縮と省力化、多様なニーズへの対応が可能に〜」

また、以下のメディアにおいても掲載頂きました(こちらで把握している限りです).

【新聞記事】
・中日新聞 R2年10月24日 (土) 朝刊1面
・朝日新聞 R2年10月24日 (土) 朝刊33面
・読売新聞 R2年10月24日 (土) 朝刊31面
・静岡新聞 R2年10月24日 (土) 朝刊33面
・日本経済新聞 R2年11月3日 (火) 朝刊38面
・日本農業新聞 R2年11月4日 (水) 朝刊

【Web記事】
・中日新聞
https://www.chunichi.co.jp/article/142375
・静岡新聞
https://news.yahoo.co.jp/articles/9440d4845f062e428a141365dba8e53366af911a
・共同通信
https://news.yahoo.co.jp/articles/3dfa2300e81fce0af28d4286d3538522b5403d15?source=rss
・時事通信
https://www.jiji.com/jc/article?k=2020110200648&g=soc

【TV放送】
・NHK静岡
https://www3.nhk.or.jp/lnews/shizuoka/20201023/3030008938.html
・静岡放送 (SBS)
https://news.yahoo.co.jp/articles/ae300c16bde6b6193150f3159e0664c068689e3c

Sci. Rep.誌に論文が掲載されました

Sci. Rep.誌に以下の論文が掲載されました.

Dissection of hyperspectral reflectance to estimate nitrogen and chlorophyll contents in tea leaves based on machine learning algorithms.
Yamashita H, Sonobe R*, Hirono Y, Morita A, Ikka T*. (Co-corresponding authors)
Scientific Reports. 10, 17360. https://doi.org/10.1038/s41598-020-73745-2 (2020)

当研究では、水耕栽培、被覆栽培および成木茶園による様々な窒素栄養条件および白葉茶系統の茶葉を対象に分光反射特性データを取得しました.
分光反射データを用いた機械学習モデルによる非破壊窒素・クロロフィル濃度の推定に加え、
緑葉と白葉の比較感度分析により、クロロフィル濃度に依存しない窒素濃度特異的と考えられるスペクトル領域を同定致しました.
静岡大学植物機能生理学研究室 (森田教授、一家准教授) 、広域生態学 (薗部 助教)、農研機構果樹茶業研究部門の共同研究になります.

D3山下 筆頭著者、薗部助教、一家准教授 責任著者の論文です.